An der Theologischen Hochschule Reutlingen bzw. ihren Vorgängereinrichtungen wird seit mehr als 150 Jahren gelehrt und geforscht. Schwerpunktmäßig wurden und werden hier die Pastorinnen und Pastoren der Evangelisch-methodistischen Kirche ausgebildet, in deren Trägerschaft die Hochschule steht. Dabei war und ist sich die Hochschule ihres allgemeinen Bildungsauftrags bewusst.

In allen Fachbereichen entstehen eigenständige Forschungsarbeiten und Veröffentlichungen (siehe Publikationslisten der Lehrenden). Aus der gegebenen Tradition heraus behält die wissenschaftlich-theologische Forschungsarbeit die kirchliche Praxis  - in ökumenischer Weite - im Blick.
Zwei Buchreihen und zwei Fachzeitschriften werden von den Professor/inn/en der Theologischen Hochschule Reutlingen verantwortet.
Durch vielfältige wissenschaftliche Kontakte und Kooperationen mit anderen theologischen Hochschulen und Fakultäten im In- und Ausland werden Arbeitsergebnisse in den ökumenischen und internationalen theologischen Diskurs eingebracht.

Die Theologische Hochschule Reutlingen unterhält zwei Sonderforschungsbereiche:

• Aus der Einbindung der Hochschule in Theologie und Praxis der deutschen Freikirchen ergibt sich als eines der Hauptforschungsgebiete die Freikirchenforschung. Schwerpunktmäßig geschieht diese Forschung im Bereich des Lehrstuhls für Kirchengeschichte, Methodismus und Ökumenik.
• Ein weiterer Schwerpunkt ist die Arbeit an Fragen der Kommunikation des Evangeliums in der Gesellschaft. Diese geschieht in unterschiedlichen Teildisziplinen, insbesondere jedoch im Bereich der Praktischen Theologie. Der durch Drittmittel getragene Stiftungslehrstuhl "E. Stanley Jones Chair of Evangelism" wurde 1992 eigens für diesen Forschungsbereich eingerichtet.